武汉市农业科学院为市属正局级事业单位，全院现下设7个研究所、1个中心和1个国有科技成果转化平台，即：蔬菜所、畜牧兽医所、水产所、作物所、林果所、农机化所、环安所、农村发展研究中心和武汉隆鑫科技投资有限公司,另有内设处室9个。
       主要开展蔬菜、畜牧兽医、作物、水产、林果、农机等农业科技的基础研究和应用研究；开展农业规划设计研究，农业生态安全、环境监测及技术研究，开展农产品质量安全检测及有关技术与标准研究；承担国家、省、市重大农业科研任务，开展农业发展战略、农业信息化、农业物联网等方面的相关研究；承担农业科技的创新、成果的转化和示范推广等工作，为农业和农村经济发展提供技术、人才和科研成果等方面支撑；开展农业专业技术人员继续教育及新型职业农民培训等工作；按规定做好国有资产的监管和保值增值，做好科技园区建设和管理等工作，为全市农业和农村经济发展提供科技支撑。